Il n’existe pas de règle spécifique. Par exemple, en cas de troubles intestinaux, il pourrait être préférable de commencer par le programme intestinal. Dans ses premiers livres, le Dr Clark recommandait de commencer par le nettoyage des parasites, suivi du nettoyage des reins puis du nettoyage du foie, puis du programme intestinal. Cependant, dans ses livres plus récents, elle faisait commencer ses patients par le nettoyage des reins et éliminer leurs bactéries hépatiques en prenant d’abord la tisane pour le foie, avant le nettoyage des parasites.
